موضع سازمان با توجه به تجربیات شخصی من که در جبهه بودم، اینها به آیت الله خامنه ای که آن موقع در اهواز بودند مراجعه می کردند و این مسئله را مطرح می کردند که یک جبهه را به ما واگذار کنید و به طور مشخص مسئولیت یک خط را برای دفاع به ما بسپارید. این نکته به این معنی بود که سلاح و تدارکات اینها مستقل باشد و این چیزی بود که به شدت دنبال می کردند و هدف کسب تجربه و شناسایی موقعیت منطقه برای مقابله با نیروهای خودی بود. در خاطرات برخی از اعضاء سازمان نیز اشاره شده است.
سازمان مجاهدین خلق را صدام به عراق دعوت کرد و مردم عراق برای او دعوت نامه نفرستادند . مردم عراق معتقدند منافقین بیشتر از ایران در عراق دست به کشتار مردم زده اند . در ابتدای راه عراق آزاد ، شورای حکومتی عراق بیانیه داد و آنها را تروریست نامید اما آن موقع عراق قدرتی برای مقابله با آنها نداشت . از زمانی که صدام سقوط کرد تا به حال ، مردم عراق از هر نژاد و گروهی و در هر جای کشور مخالف حضور منافقین در کشورشان هستند . بسیاری از کنفرانس هایی که سازمان مجاهدین خلق در عراق برپا میکند انگیزه های مادی دارد .
از همان روزهای نخست ِ پس از پیروزی انقلاب، و به ویژه پس از اعلام موجودیت حزب جمهوری اسلامی و نقش تعیین کننده آیت الله دکتر بهشتی در شورای انقلاب و مجلس خبرگان، مخالفان نظام و از جمله سازمان مجاهدین خلق، متوجه خطر وجود اندیشمندی مدیر، بر سر راه تحقق برنامه هایشان شدند. لذا ابتدا با جنگ روانی و ترور شخصیت به تضعیف او پرداختند و در نهایت با مشاهده صلابت و پایداری آیت الله بهشتی، اقدام به حذف فیزیکی ایشان کردند.
امروز سوال ملت عراق اين است كه بر طبق كدام اصل بين المللي است كه اين گروه ادعاي ماندگاري درعراق و پناهنده بودن دراين كشور رادارد ؟ كدام قانون اجازه داده است تا بر روي مردم كشور ميزبان خود سلاح بكشد و كشتار انسانهاي بي دفاع آن كشور را براي خوش آمد ديكتاتوري چون صدام در دستور كار خود قرار دهد ؟ در كدام يك از بندهاي كنوانسيون چهارم ژنو تاكيد شده است به تروريستها و كساني كه در دادگاه هاي بين المللي محكوم هستند بايد پناهندگي داده شود ؟
یکی از سران عشایر طی سخنانی ابراز داشت : ما به ایران آمده ایم تا روابطمان راتحکیم ببخشیم . ما از استان دیالی آمده ایم و می خواهم دراینجا به مساله ای اشاره نمایم و آن اینکه بین شیعه و سنی در عراق هیچ حایلی وجود ندارد و امروز تمام آنچه که از آن به عنوان اختلافات شیعه و سنی نام برده می شود مربوط به تفرقه افکنی آمریکایی ها و گروه های تروریستی است . ملت ما تمام گروه های تروریستی را رد می کند . ما به عنوان نمایندگان شیوخ عشایر عراق اعلام می کنیم که هیچ کدام از شیوخ عشایر عراق تا به حال از منافقین حمایت نکرده اند و تمام گفته های منافقین در این مورد دروغ است .
اين گروه كه به دعوت كانون هابيليان (خانواده شهداي ترور كشور) از چند روزنامه و مناطقي از ايران بازديد كردند، روز پنج شنبه گذشته، دفتر مركزي روزنامه قدس در مشهد را مورد بازديد قرار دادند. در جريان اين بازديد مدير مسؤول روزنامه قدس با اشاره به نحوه شكل گيري و برشمردن جنايات منافقين عليه مردم بي دفاع و مسؤولان نظام جمهوري اسلامي خاطرنشان كرد: اين گروهك در جريان جنگ بين ايران و عراق، اطلاعات داخلي ايران را در اختيار حزب بعث و نيروهاي صدام مي گذاشت و علاوه بر آن به ترور شخصيتها، نيروهاي حزب اللهي و سياسي پرداخت.
دولت انگلیس می خواهد انتقام آمریکایی ها را از جمهوری اسلامی ایران بگیرد، به این معنی که انگلیسی ها در این موضوع به عنوان نماینده آمریکایی ها عمل می کنند و لذا حذف نام منافقین از لیست گروههای تروریستی انگلستان در حقیقت دستور آمریکایی ها است. آمریکایی ها به این وضوح نمی توانند بنا بر منافعی که در درازمدت ممکن است داشته باشند از این گروه تروریستی حمایت علنی کنند، لذا انگلیسی ها را برای این امر جلو انداخته اندو...
این سازمان 16 هزار نفر از مردم ایران را ترور کرده است اما مردم ایران به خوبی بر مشکلات خود فائق آمدند و ریشه ی آنان را قطع کردند و آنها را از کشور بیرون کردند . آنها برای تداوم حیات انگلی خود به عراق رفتند تا به ملت ایران و عراق خیانت کنند و در جنایت های صدام شریک شوند . اهداف آنها برای آمریکایی ها بسیار جذاب بود چون اساسا آمریکا برای خدمت به عراق و مردم عراق نیامده بود. روزنامه های آمریکایی نوشتند که جنگ موجود جنگ نفت است و…
درباره فاطمه زهرا (س) از دو محور بايد سخن گفت. يك محور مربوط به تحقيقات علمى است كه براى ما ثمره علمى و نتيجه اعتقادى دارد و پشتوانه مسائل اخلاقي، فقهي، حقوقى ما هم هست. محور دوّم آن بخشى است كه مستقيماً به ما مربوط است و ما بايد تأسّى كنيم، آن را اسوه قرار دهيم، الگو بدانيم و پيروى كنيم.آن بخشى كه مربوط به مسائل اعتقادى است و ثمره علمى دارد بررسى مقام منيع آن بانو (س)است كه ايشان همتاى قرآن كريم، نبوّت، رسالت و ولايت است.
سرانجام مؤمنان در یك نتیجه گیرى منافقان را مخاطب ساخته، مى گویند: امروز از شما غرامتى پذیرفته نمى شود كه در برابر آن از عذاب الهى رهائى یابید (فالیوم لا یؤخذ منكم فدیة) و نه از كافران (و لا من الذین كفروا) و به این ترتیب كافران نیز سرنوشتى هم چون منافقان دارند و همگى در گرو گناهان و زشتیهاى اعمال خویشند، و راه خلاصى ندارند. و سپس مى افزایند: جایگاهتان آتش است (ماواكم النار)